“当代学术史研究”，创设于1990年， 并于2013入选教育部高校哲学社会科学学报名栏建设工程,2013-2014年获湖南省优秀理论栏目资助，2024年入选中宣部重点建设专栏。

“当代学术史研究”，即关于当代学术研究的学术研究，主要刊登如下四个方面的研究成果：一是宏观的学术史研究；二是学科史研究；三是学者个案研究；四是学术批评，或称学术评论。该专栏主题独特，具有鲜明个性和稀缺性，目前社科期刊界以专栏形式刊登当代学术史研究的学术成果，并一以贯之坚持三十多年的，唯有《云梦学刊》一家。

“当代学术史研究”栏目自1990年创办至今已有三十多年历史，且社会影响日益扩大，栏目质量不断提升，同时也带动了《云梦学刊》的发展，获得社会及学界一致好评。《光明日报》2004年8月26日以《〈云梦学刊〉的当代学术史研究》为题对该栏目作了报道。《文艺报》2004年8月26日以《别辟蹊径，独树一帜》对“当代学术史研究”专栏作了评述。《高等学校文科学术文摘》2004年第5期对“当代学术史研究”专栏作了介绍。2004年第4期“当代学术史研究”栏目刊发的《岳阳宣言——遵守学术规定，推动学术发展》反响强烈，中共湖南省委宣传部《理论阅评简报》对《岳阳宣言》给予肯定评价，并向全省各学术期刊推荐。2004年底，《岳阳宣言》被《社会科学报》评为国内十大社会热点之一，同时被《学术月刊》和《文汇读书周报》联合评为2004年十大学术热点之一。2005年6月，《云梦学刊》在北京大学举办的“当代学术史学科建设研讨会”分别被《中国教育报》《学术界》列为2005年十大学术热点之一。2010年7月13日出版的中共湖南省委宣传部《理论阅评简报》发表《品牌栏目：综合性学术期刊发展的核心竞争力》指出：《云梦学刊》为综合性学术期刊的发展提供了一种鲜活的参照。可以说，“当代学术史研究”专栏就是推动《云梦学刊》发展的核心竞争力。2007年元月，依托“当代学术史研究”栏目创建的“中国当代学术史研究基地”被湖南省哲学社会科学领导小组和中共湖南省委宣传部确立为湖南省社会科学研究基地。与此同时，该栏目先后多次获得“全国社科学报优秀栏目”（2006）、“全国高校社科期刊特色栏目”（2010、2014、2019、2023）、“湖南省期刊优秀栏目”（2009、2021）等荣誉称号。